Mikhail Mishustin è nato il 3 marzo 1956 a Mosca.
Nel 1989 si è laureato presso l'Università Federale Tecnologica "Stankin" di Mosca, con specializzazione in "Sistemi di progettazione automatica".
Dopo gli studi ha lavorato per alcuni anni nel settore informatico, nell'azienda MKK, di cui a partire dal 1995 ha ricoperto la carica di direttore generale.
E' datato 1998 il suo ingresso nell'apparato del Servizio Tributario Federale, con l'incarico di responsabile dell'informatizzazione dell'ente.
A partire dal mese di marzo 1999 ha ricoperto la carica di vice ministro della Federazione Russa, con delega a tasse e tributi.
Nel 2004 è stato nominato direttore dell'Agenzia Federale del Catasto russa.
Il 18 dicembre 2006 è stato nominato direttore dell'Agenzia Federale per la gestione delle Zone Economiche Speciali.
Successivamente, dal 2008 al 2010, Mishustin ha lavorato nuovamente nel settore degli investimenti, a capo del gruppo UFG-OFG Invest.
Dal 6 aprile 2010 ad oggi ha ricoperto l'incarico di direttore del Servizio Tributario Federale.
